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731部队製造细菌是使用石井四郎亲自发明的细菌培养器（加压式培养器）来进行的。这是为了在短时间内大量培养和繁殖细菌的一种创造发明。其原理很简单。

细菌喜欢肉汁、糖分等营养丰富的东西。利用这些东西製造出无菌的培养基，这是利用琼胶和胨①繁殖细菌的基础，然后只要保持一定的温度和暗度，细菌就会迅速繁殖起来，并聚集在细菌培养基的表面上。通常细菌是看不到的微小生物，但是，经过多次繁殖后，最后琼胶上呈现一种糊状辱白色的薄层，这就是製造出的细菌群体。

①胨（Peptone）：是一种用来分解蛋白质的物质。——译者

第四部的柄泽班利用特殊的传送带自动回收使鼠疫菌、霍乱菌等繁殖的细菌培养基，再利用特殊的刮取器把细菌刮取下来，然后把琼胶培养基收集起来，放入高压灭菌器中。

再向细菌刮取完毕的琼胶培养基通入高压蒸气，使它的表面恢復无菌状态，以便再次用来製造细菌。

收入高压灭菌器后，细菌培养基散发出十分厉害的臭气，它像果酱变质后的臭味，充满了整个731部队总部大楼，随着风向的变化，有时也被吹到旁边的大礼堂去。

731部队还有一个”臭气来源“：那就是解剖室及其附近的焚尸炉。

每两天”消费“三名”马鲁太“，他们的尸体就在这里火化。731部队为了消除战争犯罪的一切痕迹，所有尸体都在焚尸炉中烧掉，剩下的骨头全部扔入叫”骨坟“的大坑里。焚尸炉的烟囱虽然很高，而且采用高温焚烧方式，排烟较少，但是，由于风向的关係仍然散发出恶臭味。”马鲁太“的尸体一般都是这样处理的。但是，也有例外情况。那就是1945年8月9日731部队撤退时，对”马鲁太“的处理并未能这样做。关于这件事将在后面加以叙述。