属五大部门，科学部，情报部，行动部，财政部，后勤部，各个部门的资料开始向皮尔斯完全敞开。
接下来的半个月内，皮尔斯首先废除了尼克的内部反腐计划，声称：“神盾局内部绝对没有腐败分子。”
第二步，皮尔斯开始调整人员岗位，归属于皮尔斯这一脉的九头蛇成员，纷纷摇身一变成为神盾局各部门的中坚力量。
一时间，九头蛇以皮尔斯为首，王天，博卡，西克曼三位神盾局部长为核心，掌握了神盾局内部的绝对话语权。
情报部门的部长科尔森，还有科学部门的部长希尔被边缘化，两个部门开始由皮尔斯安插的副部长接手，相信二人距离离职只是时间问题。
科尔森也看出了情况有些不对，皮尔斯有打造一言堂得架势，归属于尼克·弗瑞一脉的老人正在受到排挤。
可是他什么也做不了，他只是情报部门主管，管不到皮尔斯头上，相反，皮尔斯现在是他的顶头上司，他才是被管的那一个。
皮尔斯接管神盾局的第二个月。
王天被提名为副局长，分管行动与训练两个部门。
月底，皮尔斯以安全理事会秘书长的身份，正式成为神盾局局长，代理二字也被拿掉了。
至此，神盾局正式进入九头蛇时代，尼克·弗瑞留下的原班人马人心惶惶，九头蛇组织由暗转明，借壳重生。
从今以后，九头蛇就是神盾局，神盾局就是九头蛇，二者再也不分彼此。
只是谁也不知道的是，王天成为副局长之后接到的第一个命令为：“剿灭以斯特拉克男爵为首的邪恶九头蛇成员。”
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