“奥本海默说的是实情”
如果我做错了什么，我宁愿挨枪子儿。
——罗伯特·奥本海默与鲍里斯·帕什的谈话
格罗夫斯将军采纳了兰斯代尔中校的建议，他们会让奥本海默继续担任这个项目的科学主管，但兰斯代尔会着手把奥本海默置于他的安全监管之下。不出所料，帕什强烈反对这种不痛不痒的解决方案，但是在1943年7月20日，格罗夫斯指示曼哈顿计划的安全部门向奥本海默颁发了安全许可。这么做是因为“不管你们掌握了哪些有关奥本海默先生的情报，他对于这个项目都是不可或缺的”。帕什并不是唯一对这一决定感到愤怒的安全官员。当格罗夫斯的助手肯尼思·尼科尔斯中校通知奥本海默，他的安全许可已经得到批准时，尼科尔斯警告奥本海默：“今后，请不要再与你那些可疑的朋友见面了，还有别忘了，无论你何时离开洛斯阿拉莫斯，我们都会跟踪你。”尼科尔斯对奥本海默充满了不信任，不仅因为奥本海默过去与共产党员有牵连，还因为他认为奥本海默把“可疑分子”招募到洛斯阿拉莫斯会危及项目安全。随着尼科尔斯与奥本海默的接触越来越多，他对奥本海默的厌恶之情与日俱增。不过格罗夫斯可不这么看，而且实际上他开始信任这位物理学家，格罗夫斯的这些表现激怒了尼科尔斯，也让他对奥本海默的怨恨越发强烈。
虽然奥本海默没能被除掉，但是其他人的处境可就没那么幸运了，例如奥本海默的门徒乔瓦尼·洛马尼茨。1943年7月27日，这位21岁的物理学家被叫到欧内斯特·劳伦斯的办公室，他得知自己将升任辐射实验室的组长。但3天后，受到帕什那份调查报告的连累，洛马尼茨收到了征兵委员会寄来的一封快递信件，要求他第二天就去体检。他立即打电话给身在洛斯阿拉莫斯的奥本海默，向他说明了情况。奥本海默当天下午给五角大楼发了电报说：“这是一个非常严重的错误。洛马尼茨现在是伯克利唯一能承担起这个责任的人。”尽管奥本海默亲自出面干预，洛马尼茨还是很快被征召入伍了。
几天后，兰斯代尔来到奥本海默在洛斯阿拉莫斯的办公室，与他进行了一次长谈。兰斯代尔警告奥本海默不要再帮洛马尼茨了，他说这位年轻的物理学家“言行不检，不能姑息迁就”。兰斯代尔宣称，即使在加入辐射实验室后，洛马尼茨仍在继续他的政治活动。“这让我很生气。”奥本海默说。因为洛马尼茨曾向他承诺，如果他加入核弹计划，他将远离政治。
随后，兰斯代尔和奥本海默谈到了共产党。兰斯代尔表示，作为一名军事情报官员，他不关心个人的政治信仰，他唯一关心的是防止机密信息传递给未经授权的人。令兰斯代尔意外的是，奥本海默表示了强烈反对，他说不希望项目的工作人员里有共产党员。根据兰斯代尔的谈话备忘录，奥本海默解释说：“人们总要面对到底要忠于谁的问题。”共产党的内部纪律“非常严格，与对该项目的绝对忠诚相互抵触”。他向兰斯代尔明确表示，他所说的只是那些现在是共产党员身份的人，以前入过党是另外一回事，他还认识几名现在在洛斯阿拉莫斯工作的前共产党员。
兰斯代尔还没来得及问奥本海默这些前共产党员的名字，他们的谈话就被一个进来的人打断了。这次谈话给兰斯代尔留下了一个明确的印象，那就是奥本海默在“试图暗示他曾是一名共产党员，而且在参与这项工作时，他确实已经断绝了与共产党的联系”。兰斯代尔的总体感觉是奥本海默“表现得十分真诚”。这位科学家“在暗示时非常隐晦”，而且“急于”解释自己的立场。在接下来的几个月里，两人偶尔会就安全问题发生争执，但兰斯代尔始终相信奥本海默对美国忠心耿耿。
然而，与兰斯代尔的谈话结束后，奥本海默却感到忧心忡忡。尽管他出手相助，洛马尼茨还是被从辐射实验室赶走了，这件事让他有些忐忑。对于导致这一结果的所谓“言行不检”，奥本海默并不知情，他推测导火线是洛马尼茨代表FAECT在辐射实验室组织工会。由此他又想到了壳牌公司的工程师乔治·埃尔滕顿，埃尔滕顿也曾活跃在FAECT，就是他让希瓦利埃找奥本海默向苏联人传递项目情报的。大约6个月前，就在奥本海默家的厨房里，奥本海默和希瓦利埃谈到了埃尔滕顿的计划，那时他只是认为此事纯属无稽之谈，可现在却显得事关重大。奥本海默与兰斯代尔的会面导致了一个命运攸关的决定：他觉得必须把埃尔滕顿的活动告知当局。
格罗夫斯将军后来告诉联邦调查局，奥本海默第一次找他谈埃尔滕顿的事是在8月初或8月中旬。但奥本海默并没有就此打住，1943年8月25日，奥本海默因项目事务到伯克利出差，他又走进了莱尔·约翰逊中尉的办公室，他是负责辐射实验室的陆军安全官员。他们先聊了几句洛马尼茨的事情，然后奥本海默告诉约翰逊，镇上有个人在壳牌公司工作，此人是FAECT的活跃分子。奥本海默说，他叫埃尔滕顿，应该对他进行监视。他暗示埃尔滕顿可能一直在试图获取辐射实验室的信息。除此以外，奥本海默没再多说什么就离开了。约翰逊中尉立即
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